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企业风采|贝普奥SISPROT试剂盒助力研究成果刊登顶尖期刊《Nature Communications》

本文转载自“贝普奥生物”微信公众号

编者按

近日,京津冀国家技术创新中心同新基金联合培育的高科技企业深圳市贝普奥生物科技有限公司(简称“贝普奥”),以其自主研发的SISPROT试剂盒及蛋白质组学样本前处理技术支持,助力南方科技大学孙颖、田瑞军团队在《Nature Communications》发文,首次揭示P3H1通过转录调控PLK1-β-catenin信号轴驱动肿瘤增殖并招募M2型巨噬细胞形成免疫抑制微环境的新机制,为靶向肿瘤-微环境互作提供新视角,尤其在克服化疗耐药方面具有潜在转化价值。


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研究背景


胰腺导管腺癌(PDAC)是恶性程度最高的肿瘤之一,其致密的间质微环境与免疫抑制特性导致临床治疗响应差。P3H1作为胶原修饰酶,近年被发现参与肿瘤基质调控,但其在PDAC中的具体作用机制尚不明确。

由南方科技大学的孙颖、田瑞军团队联合发表于Nature Communications期刊 (IF:15.7)的Targeting Prolyl 3-hydroxylase 1 Inhibits Pancreatic Cancer Progression and Macrophage Immunit通过多种蛋白质组学技术联合分析,首次揭示P3H1通过转录调控PLK1-β-catenin信号轴,不仅驱动肿瘤细胞增殖,还通过分泌组重编程招募M2型巨噬细胞,形成免疫抑制微环境。该机制为靶向肿瘤-微环境互作提供了新视角,尤其在克服化疗耐药方面具有潜在转化价值。文章中蛋白质学研究的样本前处理环节采用了贝普奥生物的SISPROT试剂盒。

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文章思路


文章首先利用已发表的糖基化分泌蛋白和膜蛋白(S-PM)数据库,结合人和小鼠(KPC模型)的转录组/蛋白组数据,筛选在PDAC中特异性高表达的分泌蛋白。通过临床样本(TMA)和数据库(KM plotter, CPTAC)验证候选基因(P3H0H1)与患者预后的关系。随后在验证队列中利用CRISPR/Cas9技术构建了P3H1敲除(KO)的胰腺癌细胞系,对野生型(WT)与P3H1敲除(KO)细胞进行转录组测序(RNA-seq),筛选差异表达基因;同时进行蛋白质组学(Proteomics)和磷酸化蛋白质组学(Phosphoproteomics)分析,筛选差异表达蛋白及磷酸化位点。通过Co-IP、免疫荧光共定位等技术验证P3H1与PLK1、β-catenin的相互作用及调控关系。最后,利用患者来源的类器官(PDOs)和荷瘤小鼠模型,评估PLK1抑制剂(BI2536)联合化疗药物的疗效。


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关键发现


蛋白组学和转录组学联合分析结果显示,P3H1的缺失显著改变了基因表达谱,证实了P3H1与PLK1蛋白存在直接相互作用,P3H1通过结合PLK1并防止其降解,起到了稳定PLK1蛋白的作用。磷酸化组数据也揭示了β-catenin是该通路的关键下游分子。综合以上发现靶向P3H1-PLK1轴能显著抑制肿瘤生长,并且能增强肿瘤对化疗药物的敏感性,为胰腺癌的联合治疗提供了有力的临床前证据。

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图1.P3H1-PLK1-β-catenin 信号轴 在胰腺导管腺癌(PDAC)进展

和肿瘤微环境重塑中的双重作用机制



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产品应用


文章在蛋白质组学研究的样品前处理环节中采用了本公司自主研发的SISPROT试剂盒处理5微克细胞蛋白样本,采用Orbitrap Exploris 480高分辨质谱仪进行检测。结果显示,与对照组相比,P3H1敲低组共鉴定到282个差异蛋白(172个上调、110个下调);在两种siRNA敲低体系及两种细胞系中,有5个蛋白呈现一致下调,包括P3H1、PLK1、CDC20、HIST1H1C和SLCO4A1。其中,PLK1作为下调最显著的激酶,且其功能与细胞增殖高度相关,被锁定为核心下游分子,为精准揭示P3H1缺失后PLK1表达下调及β-catenin Ser191磷酸化水平降低等关键发现提供了坚实的技术保障。在 5 μg 的微量样本中,SISPROT 技术不仅实现了稳定检出,更精准捕捉到了其显著的丰度变化,排除了微量样本处理中常见的随机误差,证实了该平台在微量样本关键低丰度信号捕获方面的可靠性。











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图2.SISPORT在文章中的应用


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SISPROT试剂盒凭借集成化、微量化的独特优势,实现了从蛋白富集、酶解到C18除盐的一站式处理,有效避免了传统方法中的样品损失,显著提升了检测的灵敏度与重复性。



SISPROT 

 产品优势


一站式集成

将传统多步样本制备简化为单步操作,减少损失、提升重复性

高灵敏度

低微克蛋白起始即可实现深度覆盖,适配肿瘤细胞微量样本

兼容性强

可同步支撑全局、分泌、磷酸化多组学样本制备,数据一致性高

数据可靠

组学结果经分子实验反复验证,为机制结论提供坚实支撑

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关于贝普奥生物

深圳市贝普奥生物科技有限公司是一家于2022年1月在深圳成立的蛋白质组学研发型高科技公司。作为蛋白质组学上游市场解决方案提供商,公司致力于对蛋白质组学领域的研发成果进行商业开发及转化。团队以受多项专利保护的蛋白质组学前处理系列产品为切入点,通过临床功能蛋白质组学技术平台为目标市场提供全流程解决方案。公司核心成员在蛋白质组学、肿瘤生物学领域获得重大科研成果,超半数员工拥有博士、硕士学位及海外研究经历。充满创造力的团队立足于大湾区,服务全球,专注于降低蛋白质组学分析技术难度,提升其在创新标志物和创新药物研发全链条中的应用,以蛋白质组学技术为重大疾病提供精准诊疗策略。