负责重大活动的统筹与组织实施；公文管理、法务、印章管理；保密、档案；新闻宣传、商标及品牌管理等工作。 设规划与重大任务办公室，负责经营计划与年度目标编制、经营数据统计，组织架构、人员编制及部门考核管理，制度建设，组织实施重大任务，理事会组织及主任工作支撑保障。

负责统筹推进与政府、创新平台、企业等合作，资源发展，构建创新创业生态；统筹推进入库项目合作和成果转化；管理展厅及介绍宣传材料等。 设京津冀协同创新办公室，负责统筹协调并推动京津冀协同创新的相关工作。

负责统筹管理科研体系建设，与学术机构开展交流合作；技术平台建设；统筹管理项目立项与组织实施；负责成果统计、管理知识产权、组织成果评价及奖励工作。 设政府专项办公室，负责体系建设、学术机构交流合作，技术平台建设；中央、北京市区科技相关工作管理，相关政府报告与信息报送等。

负责组织编制人才培养方案，统筹推进师资团队建设，组织各教学单位开展招生，督导教学及培训实施工作和进行培养质量评估，统筹学生及学员管理。

负责人力资源管理、党群等工作。

负责资产管理与运营、财务与会计等工作。

负责空间管理、信息化管理、后勤保障、物资采购与管理、安全管理等工作。

负责资产及财务审计、运营合规性等工作；负责开展国家和地方专项全流程的审计辅导和财务审查等工作。